Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC106Q9BWC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms