Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KATNB1Q9BVA0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms