Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAGR1Q9BTK6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAGR1Q9BTK6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAGR1Q9BTK6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAGR1Q9BTK6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms