Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT17Q9BSW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT17Q9BSW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT17Q9BSW7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms