Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms