Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOK1Q9BRS2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms