Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2Q9BQY4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms