Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ECSITQ9BQ95 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECSITQ9BQ95 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms