Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD5Q99666 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms