Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD9AQ99638 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD9AQ99638 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms