Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EYA3Q99504 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms