Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms