Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY1Q96T51 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms