Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RSF1Q96T23 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RSF1Q96T23 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms