Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CRBNQ96SW2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRBNQ96SW2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms