Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms