Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUDCD1Q96RS6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUDCD1Q96RS6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms