Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARXQ96QS3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms