Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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