Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNC2Q96PR1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms