Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms