Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF558Q96NG5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF558Q96NG5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF558Q96NG5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms