Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF396Q96N95 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF396Q96N95 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms