Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms