Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC136Q96JN2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms