Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms