Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms