Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC51Q96ER9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms