Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPDL1Q96EA4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPDL1Q96EA4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms