Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIFAQ96CG3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIFAQ96CG3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms