Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC59Q96AG4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC59Q96AG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC59Q96AG4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms