Protein–RNA interactions for Protein: Q96A22

C11orf52, Uncharacterized protein C11orf52, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf52Q96A22 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C11orf52Q96A22 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf52Q96A22 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms