Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN3Q969G5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms