Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCE1Q969G3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms