Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSR2Q969E8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSR2Q969E8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms