Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PRG4Q92954 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRG4Q92954 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRG4Q92954 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PRG4Q92954 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PRG4Q92954 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PRG4Q92954 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PRG4Q92954 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRG4Q92954 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRG4Q92954 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRG4Q92954 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRG4Q92954 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRG4Q92954 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PRG4Q92954 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms