Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT35Q92764 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT35Q92764 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms