Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TNRQ92752 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TNRQ92752 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TNRQ92752 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TNRQ92752 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TNRQ92752 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNRQ92752 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNRQ92752 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNRQ92752 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TNRQ92752 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TNRQ92752 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TNRQ92752 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNRQ92752 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNRQ92752 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNRQ92752 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TNRQ92752 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TNRQ92752 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms