Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3AQ92484 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3AQ92484 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms