Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms