Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY2Q8WXA3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY2Q8WXA3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms