Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC12Q8WUD4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC12Q8WUD4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms