Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HAVCR2Q8TDQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms