Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3LQ8TDB6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms