Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEDD1Q8NHV4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEDD1Q8NHV4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms