Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL2Q8NHH9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATL2Q8NHH9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms