Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG8Q8ND04 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG8Q8ND04 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms