Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RDH13Q8NBN7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
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