Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBI5

SLC43A3, Solute carrier family 43 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3Q8NBI5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC43A3Q8NBI5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms