Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC89Q8N998 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC89Q8N998 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC89Q8N998 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC89Q8N998 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms